Rhaid pecynnu pryd pysgod cyn ei storio neu ei ddosbarthu. Mae'r bag pecynnu yn gyffredinol yn defnyddio bag gwehyddu polyethylen. Gellir rhannu gwaith pecynnu yn ddau fath o becynnu mecanyddol a phecynnu â llaw. Mae offer pecynnu â llaw yn syml iawn, dim ond angen graddfeydd a pheiriant gwnïo cludadwy ac offer syml eraill. Ac mae graddau awtomeiddio pecynnu yn dibynnu ar faint gallu cynhyrchu a phrosesu'r ffatri. Mae'r pecynnu mecanyddol gyda gradd uwch o awtomeiddio wedi'i fabwysiadu gan fwy a mwy o weithgynhyrchwyr. Mae'r system yn addas ar gyfer gweithrediad llinell y cynulliad, strwythur cryno, llai o ardal feddiannaeth, pwyso a mesur cywir, a all wella effeithlonrwydd llafur, lleihau llafur, ac arbed costau cynhyrchu. Gellir anfon y pryd pysgod gorffenedig mewn bagiau ar ôl ei selio yn uniongyrchol i'r warws i'w storio.
Mae'r system pacio awtomatig yn bennaf yn cynnwys cludwr sgriw pacio, graddfa pecynnu meintiol awtomatig, cludwr gwregys gyda dyfais pwyso ac arddangos, a pheiriant gwnïo. Ei broses pwyso a phacio yw defnyddio swyddogaeth rheoli rhaglen y rheolydd arddangos pwyso i wireddu rheolaeth fwydo'r cludwr sgriw pacio, er mwyn cyflawni'r effaith fesur gywir. Ar ôl gorffen y pwyso, trosglwyddir y bagiau i'r peiriant gwnïo bag trwy'r cludwr gwregys i gwblhau'r gwaith selio. Gellir anfon y pryd pysgod gorffenedig mewn bagiau ar ôl ei selio yn uniongyrchol i'r warws i'w storio. Gall y system pacio awtomatig hon hefyd ddiwallu anghenion deunyddiau powdr eraill, sy'n boblogaidd iawn mewn marchnadoedd domestig a rhyngwladol.